Hôm 15/8/2002, Đức Thánh Cha Gioan Phaolô II đã chấp nhận đơn xin nghỉ hưu của Đức Giám Mục Roger L. Kaffer thuộc giáo phận Joliet. Tuy nhiên, Đức Giám Mục Roger L. Kaffer vẫn tiếp tục hoạt động mạnh sau khi nghỉ hưu. Theo chương trình ngài sẽ đi giảng trong các buổi tĩnh tâm, giảng dạy một số môn và viết các giáo trình cho một chương trình đào tạo 3 năm tại Đại Học Creighton, Nebraska.

Đức Cha tâm sự với phóng viên tờ Catholic Explorer: "Ý định của tôi là dành ra thời gian của những năm cuối cùng cho việc thánh hóa các linh mục và tu sĩ, bắt đầu với chính tôi. Khi tôi nghỉ hưu, không phải là tôi ngưng sứ vụ giám mục, nhưng là bỏ ít giờ hơn trong việc quản lý để chuyên tâm hơn vào việc mục vụ".