Sáng thứ Năm 1/8/2002, Đức Thánh Cha đã chủ sự nghi thức tôn phong Chân Phước cho hai vị tử đạo Juan Bautista và Jacinto de los Angeles tại Vương Cung Thánh Đường Đức Bà Guadalupe tại thành phố Mexico vào lúc 10:15 phút sáng.

Cũng như thánh lễ Phong Thánh cho Chân Phước Juan Diego, thánh lễ đã được cử hành bên trong Vương Cung Thánh Đường Đức Bà Guadalupe với sức chứa chỉ được 12,000 người. Hội Đồng Giám Mục Mexico đã muốn cử hành bên ngoài một quảng trường với sức chứa đến 5 triệu người nhưng Tòa Thánh không đồng ý vì ngại tốn kém. Thành ra, hàng triệu người đã phải đứng dọc theo các con đường dẫn vào Vương Cung Thánh Đường Đức Bà Guadalupe.

Ngay sau khi cử hành xong thánh lễ phong Chân Phước, Đức Thánh Cha đã ra phi trường quốc tế của thủ đô Mexico để về lại Rôma trong sự lưu luyến tiễn đưa của dân chúng xứ này. Quang cảnh tiễn đưa Đức Thánh Cha diễn ra rất bi thảm. Nhiều người khóc lóc thảm thiết vì sợ không biết có gặp lại Đức Thánh Cha một lần nữa không.

Đức Thánh Cha cũng bùi ngùi trước tình cảm dân chúng xứ này đối với ngài. Đức Thánh Cha đã ứng khẩu nói lời chia tay đầy yêu thương với dân chúng thay vì đọc những bài đã soạn sẵn:

"Khi cha sắp sửa giã biệt mảnh đất được chúc phúc này, cha muốn lập lại những lời của một bài hát rất được ưa chuộng. Tôi sắp đi, nhưng tôi không đi ... Dù tôi đi, tâm hồn tôi để lại".

Đám đông đáp lại "Xin ở lại với chúng con đừng đi". "Huynh Juan Pablo, huynh là người Mexicô."

Isabel Hernandez, 68 tuổi người đã từng đi đón Đức Thánh Cha tất cả những lần ngài đến Mexico cho biết: "Buồn quá, có thể đây là lần cuối được trông thấy ngài. Thành ra tôi cố đến đây để đong đầy con mắt và linh hồn tôi hình ảnh của ngài".

Đức Thánh Cha rõ ràng có một mối dây liên hệ khắn khít với Mexico. Ngài đã đến đây trong chuyến tông du đầu tiên của ngài và mong mỏi được dến đây bất chấp đau yếu vì bệnh Parkinson và viêm khớp".

Trong các buổi lễ, Đức Thánh Cha trông rất thích thú được nhìn thấy những vũ điệu của người thổ dân trong các thánh lễ. Ngài trông rất vui trước những biểu hiện hội nhập của Kitô Giáo trong nền văn hóa địa phương. Sau lễ phong Chân Phước, Đức Thánh Cha ứng khẩu nói:

"Trở lại đây đã mang lại cho cha một nguồn hạnh phúc thiêng liêng sâu sắc".

Rogelio Zavala cho biết "Ngài trông như người Mễ Tây Cơ khi ngài ở đây. Mexico biết cách để yêu và biết cách cảm nhận đức tin. Chúng tôi đều nghĩ ngài thuộc về Mexico".

Rất nhiều người từ chối không tin rằng đây là lần cuối Đức Thánh Cha đến thăm họ.

Ernesto Viveros, 52 tuổi nói với phóng viên thông tấn xã AP: "Đây không nhất thiết là lần cuối đâu. Nếu Chúa cho ngài sống lâu, ngài sẽ còn đến thăm chúng tôi nữa mà".

Alicia Sanchez, một phụ nữ đã 62 tuổi trèo lên ghế để trông cho rõ Đức Thánh Cha nói: "Tôi muốn thấy Đức Thánh Cha mãi mãi. Tôi thấy ngài đi thì lòng tôi rã rượi vì không biết có còn gặp lại ngài lần nữa không".

Khi Đức Thánh Cha ra phi trường hàng trăm người trèo lên mái nhà và dùng các mảnh gương để chiếu lấp lánh trên bầu trời.