Cuối cùng, chính phủ đã đồng ý ra lệnh mở một cuộc điều tra liên quan đến cái chết của Cha John Anthony Kaiser MHM, người đã chết một cách bí ẩn hai năm ruỡi về trước. Thi thể của Cha Kaiser, một Tu sĩ Dòng thánh Giuse thừa sai, được tìm thấy với một vết đạn trên đầu ở Naivasha, cách khoảng 100 km về phía Bắc Nairobi, vào ngày 24-08-2000, chiếc xe tải nhỏ của Cha nằm cạnh đó, trong một cái mương.

Cha là người tham gia vận động bền bỉ cho quyền lợi của các giáo dân của Cha ở giáo phận Ngong, Kilgoris nơi Cha làm việc mục vụ và qua đời. Hình như một số người không hài lòng với sự có mặt của Cha hoặc những hoạt động của Cha. Vào tháng 11-1999, Cha Kaiser đã bị Bộ Di trú công bố một lệnh cấm nhập cư vào Kenya, lệnh cấm cho biết là giấy phép mục vụ của Cha đã hết hiệu lực 6 tháng về trước, một lệnh trục xuất được ban hành. Nhưng sau khi giới truyền thông rộng rãi đưa tin đó là một sai lầm và với sự can thiệp của nhiều nhân vật nổi tiếng, lệnh trục xuất được hủy bỏ. Vào đầu tháng hai năm 1988, người Tu sĩ Dòng thánh Giuse thừa sai đã đưa ra bằng chứng của mình trước Hội đồng Akiwumi về cuộc điều tra chủ mưu chính trị những cuộc xung đột làm rung chuyển Kenya từ năm 1992 đến năm 1998. Cha Kaiser phục vụ với tư cách là cha tuyên úy cho khoảng 12.000 nạn nhân của sự tàn bạo này ở Maela, Naivasha. Cha đã bắt đầu điều tra tại sao người ta có mặt ở đó, họ là ai. Giáo hội Công Giáo và các nhà hoạt động chính trị ở Kenya và ở nước ngoài hoài nghi hành động xấu xa trong cái chết của Cha. Họ không tin khi Cục điều tra Liên Bang Mỹ (FBI) kết luận vào ngày 19-04-2001 rằng cái chết của Cha là “phù hợp với một vụ tự tử hơn là một vụ giết người, và vụ tự tử này do dùng súng tự bắn vào đầu” (báo cáo cuối cùng của FBI về cái chết của Cha John Kaiser, ngày 19-04-2001, trang 80).

Giáo hội và mạng lưới nhân quyền bắt đầu thúc giục chính phủ bắt đầu cuộc điều tra công khai chính thức Lễ tưởng niệm cái chết Cha như là dịp để phục hồi cuộc vận động cho việc điều tra nghiêm túc cái chết của Cha, và đưa ra những câu hỏi về nhiều cái chết không được giải quyết khác ở Kenya. Nhưng không có sự đáp trả từ văn phòng viên Chưởng lý trong suốt thời kỳ cai trị của Tổng thống Daniel arap Moi (nay là cựu Tổng thống). Nhưng vào hôm thứ Tư 02-04-2003, chính phủ mới Liên minh Cầu Vồng Quốc gia (NARC), chưởng lý Kenya Hon Amos Wako thông báo rằng chính phủ bắt đầu khởi xướng một cuộc điều tra công khai chính thức về cái chết của Cha Kaiser. “Điều tra công khai chính thức” bao gồm việc tìm kiếm đặc biệt của Giáo Hội và các tổ chức nhân quyền. Những điều đó cùng với bất kỳ thông tin nào cũng được khuyến khích đưa ra khi cuộc điều tra này bắt đầu tiến hành.